home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9410b.zip / M94A0285.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-10-08  |  4KB  |  60 lines
  1.        Document 0285
  2.  DOCN  M94A0285
  3.  TI    Nucleic acid binding properties of recombinant Zn2 HIV-1 nucleocapsid
  4.        protein are modulated by COOH-terminal processing.
  5.  DT    9412
  6.  AU    Khan R; Giedroc DP; Department of Biochemistry and Biophysics, Texas A&M
  7.        University,; College Station 77843-2128.
  8.  SO    J Biol Chem. 1994 Sep 9;269(36):22538-46. Unique Identifier : AIDSLINE
  9.        MED/94357893
  10.  AB    The nucleocapsid protein (NC) of all animal retroviruses is the major
  11.        structural protein of the core ribonucleoprotein complex, bound to
  12.        genomic RNA in mature virions. In a previous report, we showed that
  13.        recombinant NC protein from HIV-1, a 71-amino-acid protein (NC71), is
  14.        apparently able to form two types of protein-nucleic acid complexes
  15.        under low [NaCl], pH 8.3 and 25 degrees C. These appeared to differ in
  16.        occluded apparent site size, napp, forming n = 8 and n = 14 complexes on
  17.        poly(A) (Dib-Hajj, F., Khan, R., and Giedroc, D. P. (1993) Protein Sci.
  18.        2, 331-243) under conditions of high and low protein-nucleotide ratios,
  19.        respectively. Here we show that both NC71-poly(A) complexes strongly
  20.        scatter light under these solution conditions. Examination of the
  21.        wavelength dependence of the light scattering at lambda < or = 320 nm
  22.        indicates that each complex is characterized by a different scattering
  23.        coefficient. Optical density measurements suggest that upon formation of
  24.        the saturated n = 8 complex, additional polynucleotide is not
  25.        incorporated into the complex over a period of hours, i.e. the n = 14
  26.        complex is not formed via redistribution of the n = 8 complex under low
  27.        salt conditions, 25 degrees C. In contrast, the n = 14 complex readily
  28.        incorporates additional protein until that sufficient to form the n = 8
  29.        complex is present. The n = 14 complex efficiently precipitates poly(A)
  30.        and shows spectral characteristics expected for an extensively
  31.        charge-neutralized nucleic acid complex. At [NC71] in excess of that
  32.        required to form the n = 8 complex, this n = 14 complex is best
  33.        described as a kinetic intermediate on the pathway to the n = 8 complex,
  34.        which forms over a period of hours under low salt conditions, 25 degrees
  35.        C. This slow kinetics of binding provides a possible explanation for the
  36.        finding that the previously observed moderate cooperativity of Zn2 NC71
  37.        binding to poly(A) (omega = 200) at pH 8.3 and 0.29 M NaCl (Khan, R.,
  38.        and Giedroc, D. P. (1992) J. Biol. Chem. 267, 6689-6695) is shown here
  39.        to represent a nonequilibrium phenomenon, apparently converting to a low
  40.        or no cooperativity complex over a period of hours. Proteolytic removal
  41.        of the COOH-terminal 14 amino acids from NC71, forming a 57-amino-acid
  42.        protein (denoted NC57), removes this apparent binding site size
  43.        heterogeneity of NC71 on poly(A). At 20 mM NaCl, NC57 binds with n = 6-7
  44.        nucleotides, in a manner which is independent of the protein-poly(A)
  45.        nucleotide ratio. The implications of these findings on processing of
  46.        the gag precursor which leads to mature NC in HIV-1 virions is
  47.        discussed.
  48.  DE    Amino Acid Sequence  Capsid/*METABOLISM  Circular Dichroism  Comparative
  49.        Study  Gene Products, gag/BIOSYNTHESIS/CHEMISTRY/*METABOLISM
  50.        HIV-1/*METABOLISM  Kinetics  Molecular Sequence Data  Poly A/*METABOLISM
  51.        Protein Binding  Protein Conformation  Recombinant
  52.        Proteins/BIOSYNTHESIS/CHEMISTRY/*METABOLISM  RNA-Binding
  53.        Proteins/BIOSYNTHESIS/CHEMISTRY/*METABOLISM  Spectrometry, Fluorescence
  54.        Support, Non-U.S. Gov't  Support, U.S. Gov't, P.H.S.  Virion/METABOLISM
  55.        JOURNAL ARTICLE
  56.  
  57.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  58.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  59.  
  60.